Tatsuya Sato

Passionate Programmer / Father for two kids / MOSH’SH MATE

現在プライベートで使用しているMacBook Proのストレージ（500GB）のうち、「システムデータ」が約300GBを占有してしまっていた。 この空き容量を増やすため、ChatGPTに相談しながら実際にやった調査と削減の手順と実際に実行したコマンドを記録しておく。

結論： 「システムデータ」の正体は単一ではなく、スナップショット、開発環境、VM、キャッシュ、バックアップなどが混在している領域だった。 今回の主な原因はHomebrew配下に残っていたMySQLのデータディレクトリ（32GB） で、最終的に 約130GBの空き容量を確保できた。

「システムデータ」が肥大化する原因

ChatGPTによると、Finderのストレージ表示でいう「システムデータ」には以下が混ざっているという。

  • APFSスナップショット（Time Machine / OSアップデートの巻き戻し用）
  • 開発者ツールのキャッシュ（Xcode、Simulator、Android SDK、node系など）
  • Dockerなど仮想環境のディスクイメージ
  • iPhone/iPadローカルバックアップ
  • アプリのコンテナ／Application Supportの巨大データ

なので、上記を順番に該当するのか確認しながら対応していくことにした。

APFSスナップショットを確認する

ローカルスナップショットが肥大化してると「システムデータ」に乗るということで、最初に確認した。

スナップショット一覧を見る

tmutil listlocalsnapshots /

今回出たのはこんな感じ（Time Machine系じゃなくてOS更新系っぽい）：

Snapshots for volume group containing disk /:
com.apple.os.update-...
com.apple.os.update-...
com.apple.os.update-MSUPrepareUpdate

ChatGPTにこの結果について聞くと、com.apple.os.update-* はmacOSアップデートの巻き戻し用途の可能性が高いという指摘だった。 「システム設定」でアップデートを確認すると、macOSのアップデートが残っていた。 ソフトウェアアップデートを完了させ、tmutil で再度スナップショットを確認したところ、スナップショットの表示は消えた。 しかし、システムデータ自体はまだ300GB弱残っていたので、主犯は別にいるということで次の候補を確認した。

ディスクユーティリティでスナップショットを確認する

スナップショットが原因じゃないことを判断するために確認した。

具体的には、まず「ディスクユーティリティ」を開き、APFSスナップショット表示させる。 Macintosh HD - Data 側にスナップショットが無いか確認した。

確認したところ、Data側のスナップショットが無かった。 そこで次に、実体の大容量ディレクトリを探りながら確認していった。

~/Libraryのキャッシュを確認・削除する

「システムデータ」の正体がユーザー領域（~/Library）に潜んでることは多いので、最初に軽く見る。

/Library/Caches を削除

du -sh ~/Library/Caches/* | sort -h | tail -n 20

これはキャッシュのみが保存されているディレクトリなので、無条件で削除した。

Application Support の上位を確認

du -sh ~/Library/Application\ Support/* 2>/dev/null | sort -h | tail -n 20

ここで、数GB〜十数GBレベルのもの（HomebrewキャッシュやGoogle、Notionなど）が見つかった。 ただ、合計しても40GB程度なので、300GBには届かない。 そこで、もっと上位（ルート寄り）から掘る必要がある。

duコマンドで大容量ディレクトリを特定する

全体構造を一気に掴むため、 /System/Volumes/Data 直下のサイズの大きいものを調べた。

sudo du -xhd 1 /System/Volumes/Data | sort -h | tail -n 30

今回の上位は

  • /System/Volumes/Data/Users 179G
  • /System/Volumes/Data/Applications 55G
  • /System/Volumes/Data/opt 45G
  • /System/Volumes/Data/Library 34G
  • /System/Volumes/Data/private 13G

/optとUsers（特に ~/Library）の中を優先して削除候補を探していくことにした。

Homebrewのvarディレクトリに残ったDBデータを削除する

Homebrewの本体は普通 Cellar のサイズが大きくなると予想されたが、今回は違った。

/opt の内訳

sudo du -xhd 1 /opt | sort -h | tail -n 30

44G /opt/homebrew

さらにHomebrewの内訳を調べた。

sudo du -xhd 1 /opt/homebrew | sort -h | tail -n 30

ここで上位に出てきたのが、以下の2つだった。

  • /opt/homebrew/Cellar 10G
  • /opt/homebrew/var 32G

var、 つまりサービスのデータが肥大化していると考えられる。

さらにその内訳を調べてみた。

sudo du -xhd 1 /opt/homebrew/var | sort -h | tail -n 50

するとMySQLのディレクトリがほとんどを占めていた。

32G /opt/homebrew/var/mysql

brewコマンドで念の為今は使用していないことを確認した。

brew list --formula | egrep '^(mysql|mysql@|mariadb)$' || true

何も出てこなかったので、現在このMacbookにはインストールされていないことがわかった。

念の為、それ以外の経由でもmysqlが存在していないかを、デフォルトのポート番号3306使用しているプロセスが存在しないか確認した。

lsof -iTCP:3306 -sTCP:LISTEN || true

ps aux | egrep 'mysqld|mariadbd' | grep -v egrep || true

ここまでで何も出てこなかったので、使ってないデータディレクトリだけ残っていると判断した。

rm -rf /opt/homebrew/var/mysql

lima/colimaの不要なVMを削除する

sudo du -xhd 1 /Users/<user> で見つかった大物のひとつが ~/.lima。 これは、以前にLinux上でないと動かせないDockerイメージを利用する必要があったため使用していたcolimaのVMの残りだった。 もう使ってないので、 limactl delete で不要なVMを削除した。

~/Libraryの大容量ディレクトリを特定する

~/Library の直下ランキングで、どこが太いか確定させた。

sudo du -xhd 1 /Users/satoutatsuya/Library 2>/dev/null | sort -h | tail -n 40
  • ~/Library/Application Support 28G
  • ~/Library/Containers 23G
  • ~/Library/Developer 14G
  • ~/Library/Android 12G
  • ~/Library/pnpm 1.8G

Containersディレクトリを確認する

Containersの中にDockerを発見

sudo du -xhd 1 "$HOME/Library/Containers" | sort -h | tail -n 50
  • com.docker.docker 19G
  • com.microsoft.teams2 1.5G

Dockerのコンテナイメージなどがディスクを食っていそうなことがわかった。

Docker Desktopのディスク使用量を削減する

まず状況確認をした。

docker system df

キャッシュ削除と未使用イメージ、コンテナ、ボリュームを削除した。

docker builder prune -a
docker system prune -a --volumes

Xcodeシミュレータのキャッシュを削除する

ChatGTP曰く、Xcode関連で使用されるディレクトリ類らしい。 実際に以下を実施した。

xcrun simctl delete unavailable
rm -rf ~/Library/Developer/CoreSimulator/Caches
du -sh ~/Library/Developer/CoreSimulator

結果、1GBくらい削除できた。 iOSシミュレータの本体は Devicesディレクトリにあるので、もっと空き容量を作るには Devices を消す必要があるらしい。 今回はそこまで手を入れなかった。

macOSのシステムデータを減らす手順まとめ

  1. tmutil listlocalsnapshots / でスナップショット確認（OS更新系ならまずアップデート完了）
  2. sudo du -xhd 1 /System/Volumes/Data ... で「どこが太いか」決め打ち
  3. sudo du -xhd 1 /opt/homebrew ... → var が太いならサービスデータ（DBなど）疑う
  4. /opt/homebrew/var/mysql みたいな “残骸datadir” を、起動確認してから削除
  5. ~/Library を分解して、内容を確認

まとめ：開発環境の残骸がシステムデータを圧迫していた

今回、最終的に130GBくらい空きが増えた。 「システムデータ」って名前のせいで“OSが食ってる？”と誤解していたが、実態は開発環境や仮想環境の残骸が原因だった。

同じ症状の人は、まず /System/Volumes/Data を du で分解して見ていくことをおすすめします。

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